怎样解释mRNA和蛋白质表达水平不一致,甚至相反
发布网友
发布时间:2022-05-04 11:00
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热心网友
时间:2022-06-21 08:46
特定基因的mRNA丰度不一定与其翻译产物--蛋白质的表达量成线性关系,因为基因表达的*层次很多,转录水平的*只是一个环节,还有转录后*和翻译及翻译后*都对于最后蛋白的表达量起作用。再有就是mRNA的降解、蛋白的降解、修饰折叠等因素都可能导致mRNA丰度与蛋白表达水平不一致。
另外许多基因的表达量随时间的变化而变化,存在峰值(量多)和谷值(量少)。因此您研究的基因如果有周期波动,您的结果就完全可能,因为有文献报告蛋白的表达比mRNA滞后3小时左右,因此如果你调整一下检测蛋白表达量的时间,也许蛋白表达量就与已有结果mRNA一致了。
热心网友
时间:2022-06-21 08:47
用蛋白质组方法找到一些差异表达蛋白,现对鉴定成功的蛋白设计引物后用real-time PCR方法进一步从mRNA水平验证差异表达。但是有一些蛋白和对应的mRNA变化趋势对不上(比如蛋白水平在不同时间点上是逐渐上调的,但是mRNA 水平上有下调的趋势,或者有先上调再下调的趋势,等)。在写文章了,不知道这个情况如何理解,文章写作上又如何解释?恳请帮忙,谢谢!
关于mRNA水平与蛋白质水平不符的问题,本人认为应该这样分析:
1.首先确保试验所取的样品必须等量,这是分析问题的前提
2.对于等量的样品所提取的蛋白及核酸,两者在不同时间上不符,要考虑到翻译后修饰的问题,即蛋白的高级结构中有未知激活因子的活性位点,在胞内随着激活因子浓度的不同,蛋白的浓度是被影响的(考虑蛋白有没有不同的活性形式)
3.对于mRNA水平有下调趋势,蛋白的表达却较高的问题本人的卓见是应考虑该蛋白在mRNA水平即基因水平还未被正调节表达增高时,存在组成型表达的蛋白被胞内的激活因子调节而成为有活性的形势。