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3️⃣ 多序列比对(1):简介

发布网友 发布时间:2024-05-02 07:00

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热心网友 时间:2024-05-16 08:57

关于多序列比对可以参考 Wiki

多序列比对是对3条以上(包括3条)DNA,RNA或蛋白序列进行比对。基础仍然是双序列比对。
具体就是对多条序列插入空位,是的插入空位后的全局比对结果有相同的长度,并且结果中不能出现一列全部是空位(也就是每条序列的同一个位置都没用字母)。

是发现 多条序列的共性,通常是为了发现构成同一基因家族的成组序列之间的共性,而发现这些共性对研究分子结构,功能及进化关系都有着非常重要的作用,有助于阐明一组相关序列的重要生物学模式。

工作绩效考核内容

2. 采购成本(原材料成本、设备成本、进货成本) 3. 管理成本(运营成本节约率) 4. 营销成本(费销比) 5. 人员工资成本(人才达成率、人才培训率、工作饱和度、工资效益比) 6. 税务成本(节税率、税销比) 7. 商业模式建设(商业模式的量化、标准化、有形化) 8. 生产系统建设(生产流程、标准的制定、颁布、培训...

生物信息怎样序列比对需要哪些数据

序列比对(Sequence Alignment)的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。从生物学的初衷来看,这一问题包含了以下几个意义:从相互重叠的序列片断中重构DNA的完整序列。在各种试验条件下从探测数据(probe data)中决定物理和基因图存贮,遍历和比较数据库中的DNA序列,比较两个或多个...

(一)构造地层序列对比

表3-3 大别造山带与秦岭、苏鲁造山带地层序列对比表 注:1.中新生代地层序列对比参见表3-2;2.打问号者时代归属尚有争议。 胶南群与大山沟岩组(山东区调队,1982)主要分布于鲁南日照一带,由大量变形变质侵入岩(新元古代)以及包裹于其中的表壳岩(斜长角闪岩、黑云变粒岩、二长浅粒岩、黑云片岩、透闪透辉大理岩...

二级结构的编号

DSSP是“Define Secondary Structure of Proteins”的缩写,它是一编文章正式列出已知三维结构的蛋白质二级结构。DSSP编号一般是用单一英文字母来描述蛋白质二级结构。二级结构是根据氢键模式来指定的。* G:3转角螺旋(亦即310螺旋)。最短长度为3个残基。* H:4转角螺旋(α螺旋)。最短长度为4个残基。

pr序列设置

1、首先打开pr,自带的序列设置中有很多预设的序列,切换到设置页面,编辑模式改为自定义,开始进行设置。2、时基设置的是帧数,帧数越高,在pr剪辑中预渲染效果越好。就是在编辑中按下Enter键,自动播放的画面。3、视频界面画面大小是设置画面的宽高的数值,比如要1080p的话,就要设置1920的宽度和1080...

基因家族分析(3)进化树构建及美化

基因家族分析的关键步骤包括进化树的构建与美化。常用的构建方法有NJ法和ML法,首先需要进行多序列比对,通过比对将核酸或氨基酸序列对齐,识别相似部分。muscle是常用的多序列比对工具,对于大量序列或ML方法建树,个人电脑可能处理不了,推荐使用服务器。对于NJ树,treebest是Linux服务器上的选择,而fasttree则...

3代基因组序列比对需要什么数据来源

3代基因组序列比对需要PacBio数据来源。根据查询相关公开信息显示,PacBio数据来源是稳定可靠的,错误率很低的一种数据,很适用于3代基因组序列比对。

测序相关知识总结

高通量测序技术(High-throughput sequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变,一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为...

怎么利用bioedit做序列的比较

1、网络搜索下载并安装BioEdit软件。2、将你所要比对的序列以fasta格式粘贴在文本文档里。3、BioEdit软件打开文本文档,选中所有的序列,按下图方法选择要打开的标签。4、在新的窗口中,按下图所示勾选Note下面的方框(勾选之后可以在比对的结果中用星星表示,方便你看出哪些地方不一致)和运行“RunClustalW...

WPS表格如何按列插入数字序号

1、打开想要插入数字序号的表格,选择想要插入序号的列。如上图所示,先在姓名栏左边添加【序号】栏。2、在【序号】列,先输入想要插入的数字序号格式,如1、2、3、4……则先输入“1”即可。鼠标拖动数字 “1”单元格右下角的正方形,往下拖动。3、WPS表格功能会自动插入填充完整数字序号。效果如上...

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