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wilcox.test 进行 RNAseq 差异表达基因分析

发布网友 发布时间:2023-07-09 08:50

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热心网友 时间:2023-07-12 19:10

如果拿到的表达谱不是原始的read counts数据而是TPM值,就不能用包(比如DESeq2)来进行差异表达基因分析。我们可以手动用wilcox.test 函数手动进行分析。我的数据为log2TPM的表达矩阵

这样就可以进行后续分析了。
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