为什么引物设计时要避免出现多个G?

发布网友发布时间：2022-04-24 23:34

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热心网友时间：2023-10-14 21:24

引物3'端是引发延伸的起点，因此要与模板准确配对。四种碱基引发错配有一定的规律，以3’端A的影响最大，......当末位碱基为A时，错配的引发率大大降低，当末位为T时，错配的情况也能引发链的合成。因此，应尽量避免在引物3'端的第一位碱基是T。引物3’端的最佳碱基的选择的G和C，因为它们形成的碱基配对比较稳定。确保引物中GC含量在30-80%。应避免引物中多个重复的碱基出现，尤其是要避免4个或超过4个的G碱基出现。引物的3’端最好不为G或/和C。引物3’端的5个碱基不应出现2个G或/和C。

热心网友时间：2023-10-14 21:25

楼上能不能不要CTRL+C CTRL+V，回答的也不是很准确
引物设计有N多原则，我就不多说了
其中有一条原则就是不能连续出现多个G
原因如下：
1：碱基配对原则中G与C配对有3个氢键连接，而A与T之间有2个氢键连接。
2：在做PCR扩增时，有个退火温度，如果G太多就必须提高退火温度，如何提高退火温度的话，考虑一下DNA聚合酶吧，既然是酶（本质是蛋白质）在高温下活性会降低