如何利用Bio-Rad CFX Manager 3.1分析QPCR数据
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发布时间:2022-04-26 07:46
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时间:2022-06-25 11:17
1、百度搜索下载免费的Bio-Rad CFX Manger3.1软件,下载完毕后安装到你电脑上。
2、在电脑上点开Bio-rad-2软件,会出现一系列的文件夹和应用程序扩展以及应用程序之类的,专门找到应用程序里面的BioRadCFXManager。
3、点击步骤二中的应用程序。程序开启的速度有点慢,请耐心等待。关掉弹出来的无关窗口,点击File,下拉选择Open,选择横向的Data File,点击Data File,弹出你要选择加进去的QPCR数据文件。
4、完成步骤三后会弹出你的QPCR曲线结果图。开始对结果图进行分析。首先点击Quantification那栏,看看QPCR的特征曲线跑得怎么样。用鼠标随意点击上面的一条绿色曲线,就出现相对应的哪个孔的Cq值。
5、开始对曲线进行分析。这里的曲线多数分为两大类,分别代表了两种不同的引物的扩增曲线。曲线中另外出现了两条水平的线,一条在0刻度线处,代表该孔未加染料(QPCR
mix);而另一个孔在0-100之间,代表该孔未加模板cDNA,导致无法起峰进入平台期。这两条曲线去掉,不做数据分析。另外跟这两大群主峰的曲线分散比较大的杂曲线,也作为误差较大曲线,数据分析的时候弃掉不用。
6、点击Melt
Curve,一般有几个引物便会出现几个特征性的主峰。并且大部分曲线都会簇拥在它们的主峰里面。将数据导出来分析要返回到Quantification,在Cq值下面右击,出现Export
to excel,点击,即可保存为Excel表格,分为07和03版本。