求助分子生物学的高手,怎么筛选目的基因,做PCR验证?

发布网友发布时间：2022-05-22 01:42

共3个回答

热心网友时间：2023-11-24 11:38

我本人没具体做过信息学，有个师弟以前做过，就我薄弱的了解，我觉得其实你自己想的方法已经是正道了。
由于你现在是时间有限，虽然你调高SAM参数有可能漏掉关键基因，但应该会缩小目的基因范围。用GO分析也是个好办法，你已经有了前期的基础，你完全可以把GO做丰富点，把pathway和网络分析耐心做做。
把这两种途径结合起来，只要你的实验没问题，一步步的来，范围就比较明确了，同时这两者之间的交集就是你的重点。

热心网友时间：2023-11-24 11:39

想缩小范围就漏掉了一些基因，不过也是一种办法，尝试把参数提高设置，拿到一些基因，同时这里面未必有真正感兴趣的基因在里面，从功能里筛选一些基因做PCR ,总之就是两个结合好，缩小基因数目与感兴趣的基因，最好存在交集，那就可以节省很多时间和money。。。

热心网友时间：2023-11-24 11:39

查文献选最重要的基因做各个pathway上最上游的基因