本人不会genbank,请高人指点。。。
发布网友
发布时间:2022-05-22 09:34
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热心网友
时间:2024-03-07 21:36
生物信息学很好玩的,自己做一个就有感觉了
1.随便找一个你知道的基因,用NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 搜它的序列
2.用序列BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome 网站给分析,甚至能建树。
3.启动子预测太多了,但有种特异性的,可以参考http://blog.sina.com.cn/s/blog_51146f9b0100claj.html
4.蛋白分析:
由TMHMM服务器预测(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/)的跨膜区
ExPaSy(http://us.expasy.org/tools/ ) 软件包Protparam工具进行氨基酸组成、分子质量、等电点分析
利用利用SignalP 3.0 Server (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ )和TMpred (http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html),分析可能的跨膜螺旋区,并得到跨膜的拓扑模型。
通过PM (http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopm.html)工具,预测基因编码蛋白质的二级结构
用CD search工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)预测蛋白质的保守结构域,