高通量测序的结果怎么计算覆盖率

发布网友发布时间：2022-05-17 08:46

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热心网友时间：2023-10-15 20:08

覆盖度是指测序产出的数据覆盖到目标基因组上的比例，与测序深度相关。以人类基因组测序为例：测序深度=reads数×片段大小（bp）/3000000000。如果文库片段是100bp，产出500w的reads，那么其测序深度是0.167×，覆盖度是16.7%。在1×测序深度以内，覆盖度与测序深度呈正相关的比例，当测序深度达到一定程度时覆盖度并没有显著提高。同样以人类基因组为例：1×测序深度其覆盖度是63.21%，2×测序深度其覆盖度是87.46%，5×测序深度其覆盖度是99.3%，10×测序深度其覆盖度是99.99%

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