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师兄您好!请问怎么做绝对定量qpcr?

发布网友 发布时间:2024-10-03 20:32

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热心网友 时间:2024-10-04 02:31

在师姐的悉心指导下,我对实验流程进行了全面审视与改进,尤其注重了样品加样的精准度,最终成功绘制出了令人满意的曲线图。本周的组会,我终于能够自信地分享出此次实验的成果。

人们常认为 qPCR 实验充满了玄机,往往需要付出大量时间和精力却难以获得预期结果。实际上,这往往是因为在一些细枝末节上没有做到位。接下来,我将分享一套关于 qPCR 实验的准备与执行策略,旨在帮助你优化操作,减少实验失败的风险。

首先,让我们从实验准备阶段开始。确保你的实验仪器(移液枪与 qPCR 仪)保持良好的校准状态,一般建议每年进行一次校准,以确保数据的准确性。选择适合的引物同样重要,优先选择扩增效率在 90%~110% 的引物,并验证其融解曲线为单峰,以确保高效且特异的扩增效果。

内参的选择与验证同样关键。你可以根据已发表文章的推荐,选择相同物种的内参进行测试。如果找不到合适的内参,选择常见的内参或从内部控制基因库中寻找也是不错的选择。确保你选择的内参在不同样本处理下表达差异不显著,以保证后续实验的稳定性和可靠性。

样品 cDNA 的处理也很重要。理论上,每稀释 10 倍,CT 值会增加 3.3,你可以根据这个规律进行合适的稀释。推荐使用 cDNA 原液、10 倍稀释液、100 倍稀释液等进行梯度稀释,选择 CT 值落在 18~28 范围内的稀释倍数进行定量实验。

接下来,进入实验操作阶段。提前排版与预混,确保准确加样,避免混淆。例如,如果你想比较未处理(对照组)与经处理后(处理组)样本中某基因的表达变化,你需在实验板上进行合理的分组与排板设计。记住,每个处理需做三个复孔,并确保每个孔内的液体体积保持一致。

预混试剂时,使用大体积配置可以增加复孔的重复度,减少误差。对于每个处理组,每孔的加样体积为 10.8 µl(qPCR Mix + 引物)+ 9.2 µl(cDNA 模板)。对于 NTC(无模板阴性对照),每孔的加样体积为 10.8 µl(qPCR Mix + 引物)+ 9.2 µl(ddH2O)。

加样过程中,确保环境的清洁与操作的精确。在配置预混液时,应在超净工作台中进行,避免污染。确保预混试剂在冰上操作,并避免强光直射,以防止模板降解、酶活降低及荧光淬灭。进行加样时,先加大量,后加小量,并注意加样顺序,以减少误差。

最后,确保机器程序的准确性。在诺唯赞 Q712 反应程序、ABI Q3 仪器上进行设置时,要仔细检查管材中无气泡,并避免在管口对准的管盖部分做标记。程序设置包括温度、时间、循环次数等,确保填写正确,并开启荧光采集功能。使用仪器默认的融解曲线采集程序,以确保数据的准确性。

通过以上步骤的严格把控,你可以大幅提高 qPCR 实验的成功率,并获得更加可靠的数据。希望这些经验能够帮助你在实验过程中少走弯路,顺利取得理想的结果。
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