逆转录PCRPCR各步骤的目的
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发布时间:2024-07-22 17:07
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时间:2024-08-09 06:38
逆转录PCR和PCR各步骤有着明确的目的,以确保高效和精确的扩增过程。
首先,预变性是关键步骤,通过高温破坏DNA的二级结构,增强模板的可扩增性。它有助于引物与模板的结合,尤其对于基因组DNA,充分变性是必要的。在使用热启动Taq酶的反应中,预变性还激活了酶的活性,促进PCR反应的进行。
PCR的三个循环主要包括:模板DNA的变性,通过加热至93℃使双链DNA解离为单链,为引物结合创造条件;模板DNA与引物的退火,将温度降至55℃,引物与单链DNA的互补序列配对;然后是引物的延伸,TaqDNA聚合酶以dNTP为原料,按照碱基配对原则,复制出一条新链,形成半保留复制。
延伸时间的选择是根据目标DNA片段长度决定的。短片段通常只需1分钟,长片段则需要更长。最后一轮通常延长至4-10分钟,以确保完全扩增并便于后续的TA克隆。此外,延长的10分钟还有助于添加A尾,便于后续的克隆应用。
PCR引物的选择需谨慎,要避免形成同源多聚体、二级结构和自我互补。计算熔解温度,确保正反向引物的GC含量相似,目标片段的GC含量应在40%-60%之间。引物长度和位置需调整,3'末端应为G或C,且避免引物间的互补性。一条引物不应有连续三个互补核苷酸。
在实际操作中,变性温度应根据模板的C+G含量确定,复性温度需控制在适中,避免非特异性结合。PCR循环次数取决于模板拷贝数和效率,理想的扩增产物应是特异性的,非特异性产物应非常低。例如,在TaqDNA聚合酶条件下,30个循环后,如果起始拷贝数为10的5次方,通常可以得到理想的结果。
扩展资料
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逆转录PCR的PCR各步骤的目的
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