gromacs教程-13-CPU版-虚拟机安装

发布网友发布时间：2024-09-03 19:50

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热心网友时间：2024-09-03 19:55

Ubuntu安装-无gpu加速版本

使用命令行安装Gromacs：sudo apt-get install gromacs。该方法适用于没有GPU的情况，适用于生成文件或者不希望使用个人电脑运行。

虚拟机-无gpu加速版本

1. 访问官网下载VMware。

2. 按照默认设置安装。

3. 创建新虚拟机。

4. 选择稍后安装操作系统。

5. 确定虚拟机操作系统类型。

6. 新建目录用于存放虚拟机。

7. 配置映像文件。

8. 完成虚拟机创建。

4. 启动并安装虚拟机系统。

5. 输入语言，正常安装。

6. 选择磁盘分区。

7. 填写虚拟机登录信息。

8. 等待安装。

9. 重启。

10. 终端安装Gromacs：sudo apt-get install gromacs。

虚拟机共享主机文件

在VMware中，可以通过类似docker的方式挂载主机目录给虚拟机，方便在虚拟机上访问共享目录。

3. 现在可以看到共享目录路径。

共享目录使用：

1. 在虚拟机中进入共享文件。

2. 复制虚拟机文件夹到共享文件：cp -Rf /home/database/* /mnt/hgfs/数据库/database/。

虚拟机可以访问主机目录，并可将运行结果直接保存在主机共享目录。

虚拟机共享主机文件夹无文件，mnt/hgfs路径为空。

1. 打开共享文件夹。

2. 运行虚拟机，命令行输入：su root。

3. 分别输入以下命令：

1 cat >> /etc/fstab << EOF

2 .host:/ /mnt/hgfs fuse.vmhgfs-fuse allow_other,defaults 0 0

3 EOF

4 exit

4. 重启虚拟机后，即可看到 mnt/hgfs 路径下的共享文件夹。

Gromacs运算

使用自己的电脑进行Gromacs运算而没有GPU加速，会浪费计算资源。若没有服务器的GPU，使用此方法较为合适，仅适合生成文件供其他高性能机器运行。