“生信零代码”时代来临:Cell的分析照样零基础做
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发布时间：2024-09-26 06:26
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时间：2024-11-08 14:58
Cell上发表的“Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations”等文章，以及耶鲁大学陈列平教授团队在Nature Medicine上发表的关于Siglec-15的文章，都利用了TCGA数据库进行深入分析，展示了生信在科研中的强大应用。
然而，对于没有编程技能的人来说，如何利用生信提高科研效率呢？科研界亟需一个不需要代码、功能强大的可视化分析工具。在中国科研工具箱平台“科研者之家”上，已经出现了一个“生信零代码”版块，整合了TCGA、GEO、Target、ICGC、CCLE五大公共数据库的样本数据，用户可以直接使用。
该平台由临床医生和生信专家联合构建，界面简洁，功能强大。例如，在TCGA模块，用户可以轻松筛选数据并进行各种分析，如比较肺腺癌里EGFR突变和野生型病人的基因表达水平和预后差异。平台不仅提供了强大的样本筛选功能，还能进行单样本和多样本分析，覆盖临床信息比较、基因与生存分析、基因与TMB/MSI分析等。
在复杂分析中，用户可以使用亚组分型、基因突变景观、差异基因分析等模块进行深入研究。此外，平台还提供了思维导图和视频教程，指导用户如何使用“十字研究法”进行课题设计。
使用这个平台，用户可以生成高清矢量图并下载原始数据，每个分析结果还附有图例、方法学、中英文对照结果和参考文献，大大提高了文章撰写质量。从课题设计到零代码分析，再到论文写作，这个由医生创建的生信平台充分满足了广大科研人员的需求。
