实用的在线生信工具汇总(一)
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发布时间:2024-10-01 15:06
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时间:2024-10-01 15:21
在生物信息学研究中,非专业人员也能轻松应对分析任务。无需掌握复杂的Python、Perl或R语言,许多在线工具已具备强大的功能。本文将分享几个专注于转录组分析的在线工具,帮助你高效处理数据并生成所需的图表。
首先,Venny2.1(bioinfogp.cnb.csic.es/t...)是一个用于绘制韦恩图的在线工具,可直观展现多个数据集间的差异。只需输入数据列表,选择风格并导出图片,便可快速完成韦恩图的生成和保存。
其次,Agrigo v2.0(systemsbiology.cau.e.cn...)针对农业研究提供丰富的分析工具,包括基因富集分析。以拟南芥为例,选择物种,输入差异表达基因ID,即可得到基因富集分析结果,包括物种信息、层次图、柱形图和详细通路信息。
KEGG (kegg.jp/kegg/kegg2.html)是另一个强大的资源,整合基因组、化学和系统功能信息。在分析转录组时,可通过搜索特定代谢通路如植物激素信号转导,查看相关基因和酶的分布。使用KEGG Maper工具,你可以根据基因ko编号和颜色,生成包含关注基因的代谢通路图。
这些在线工具让转录组分析更加直观和便捷,无论是韦恩图的对比、基因富集分析还是代谢通路可视化,都能在无需深入了解编程语言的情况下完成。如果你对KEGG或其他功能感兴趣,欢迎进一步探索和提问。