一种蛋白质可以被某种蛋白水解酶分解,为什么可以分解?为什
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发布时间:2024-10-16 19:39
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时间:2024-11-25 05:04
蛋白酶是催化肽键水解的酶,其作用在于降低反应壁垒。人体的36.5度体温、7.4 pH与体内水解酰胺的需要生物催化剂相符。其中,丝氨酸蛋白酶的活性位点中的丝氨酸支链羟基水解酰胺。以新冠病毒的主蛋白酶Mpro为例,它通过活性位点中半胱氨酸的支链硫醇水解酰胺。然而,His41-Cys145在活性位点中构成催化二元体,其中组氨酸作用于激活半胱氨酸,通过一系列化学反应形成硫酯中间体,最后水解为羧酸。
Mpro对底物的取代基R1和R2有选择性,以避免随意水解肽键。以可切键为例,将其标记为NH一侧的氨基酸依次标记为1', 2', 3', 4'等,C=O一侧标记为1,2,3,4等。主蛋白酶对于可切键周围氨基酸的选择性如下:P1位置的谷氨酸选择性显著,所有以非典与新冠病毒主蛋白酶为位点的拟肽药物都利用了谷氨酸或其伪装。以Paxlovid中的Nirmatrelvir为例,C≡N被视为可切键,内酰胺环为P1位置的伪装谷氨酸。化学上,这种选择性源于蛋白酶活性位点的结构。