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R笔记:两独立样本的差异显著性检验

发布网友 发布时间:2024-12-10 04:15

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热心网友 时间:2024-12-10 04:21

在生物医学研究中,比较两个组间的差异性是常见行为,这可以分为独立组间的比较和相关组(配对组)的比较。独立组比较时,需要考虑数据类型选择合适的方法:定量资料间的比较通常使用两独立样本的t检验,无序的分类资料间的比较则采用卡方检验。如果定量数据不满足t检验的条件或为有序多分类数据,则可能需要考虑非参数检验。

具体而言,两独立样本的t检验通常在数据正态且方差齐时使用。示例中通过调用shapiro.test和leveneTest进行正态性检验和方差齐性检验,结果表明数据满足正态分布和方差齐性。采用t.test进行t检验后,结果提示无显著差异(P-值>0.05)。在进行数据载入和处理时,将需要比较的数据赋值到新对象,便于后续操作,例如使用x<-ttest[1:40,1]等简化代码。

当数据不满足正态分布或方差齐性时,可以采用非参数检验。例如,使用wilcox.test进行Wilcoxon秩和检验,结果同样表示无统计学差异(P-值>0.05)。值得注意的是,当数据中有重复值(即"结"现象)时,R的P值计算可能会给出近似值,而非精确值。

卡方分析用于处理四表格资料、双向无序的行列表资料或分组变量有序、结局变量无序的行列表资料。进行卡方检验时,首先生成列联表,可使用table或xtabs函数实现。在数据满足卡方检验条件时,结果可能提示无统计学差异(P-值>0.05)。如果条件不满足,如单元格值小于5,可以考虑使用连续校正的卡方值或Fisher精确检验。

综上所述,通过灵活选择合适的统计检验方法,可以有效地分析两个独立样本间的差异性,为生物医学研究提供支持。
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