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什么实验适合做转录组

发布网友 发布时间:2022-05-12 03:06

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热心网友 时间:2023-11-05 14:48

取样实验适合做转录组。

转录组测序关键是取样,选择合适的处理以及对照。除测序数据量外,还有很多指标可以衡量转录组测序质量的,如rRNA消除比例、测序plicated reads的比例、每个转录本的测序均一性、测序的可重复性、不同GC或不同长度转录本的表达丰度是否存在偏移等。

区别

全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。反映出它们的表达水平。基因表达谱指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息,这样编制成的数据表就称为基因表达谱。

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