发布网友 发布时间:2022-04-22 05:46
共2个回答
懂视网 时间:2022-04-10 00:00
首先,进入千人基因组数据库的网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/
如下图所示,在数据库的框框里输入我们感兴趣的SNP,比如rs608139
搜索后出现如下界面,黄色区域是我们感兴趣的SNP,红色框框是不同国家和地区在该SNP对应的频率和个数。
千人基因组数据库包括的国家和地区如下表所示。
国家 |
Continent |
Population (Abb) |
中国,北京 |
Asian |
CHB |
日本,东京 |
Asian |
JPT |
中国,南方 |
Asian |
CHS |
越南 |
Asian |
KHV |
来自英国的印度泰卢固语人 |
Asian |
ITU |
孟加拉 |
Asian |
BEB |
中国傣族,西双版纳 |
Asian |
CDX |
来自英国的斯里兰卡泰米尔人 |
Asian |
STU |
古吉拉特印度人,来自休斯敦,德克萨斯 |
Asian |
GIH |
巴基斯坦 |
Asian |
PJL |
秘鲁 |
South America |
PEL |
芬兰 |
Europe |
FIN |
美国洛杉矶人,墨西哥祖先 |
North America |
MXL |
犹他州(CEPH),来自欧洲北部和西部的血统 |
North America ( Europe ancestry) |
CEU |
托斯卡尼 |
Europe |
TSI |
来自英国和苏格兰的英国人 |
Europe |
GBR |
来自麦德林的哥伦比亚人,哥伦比亚 |
South America |
CLM |
在西班牙的伊比利亚人 |
Europe |
IBS |
波多黎各 |
North America |
PUR |
非洲血统的美国人 |
North America(African Ancestry) |
ASW |
非洲加勒比地区 |
America |
ACB |
冈比亚人 |
Africa |
GWD |
埃桑人,尼日利亚 |
Africa |
ESN |
肯尼亚 |
Africa |
LWK |
在塞拉利昂(非洲)曼德人 |
Africa |
MSL |
约鲁巴人,尼日利亚 |
Africa |
YRI |
利用千人基因组数据库查看SNP在不同地区、国家、洲的频率及个数
标签:技术分享 不同 border 界面 too 包括 tin 下界 jpg
热心网友 时间:2022-04-09 21:08
相信各位掌柜不管是做淘宝多长时间,应该都是听过一个词的。“个性化”,其实早在2013年的时候淘宝就开始推出“千人千面/个性化”这个算法,也就是程序猿嘴里的“推荐算法”,那大家都听过,这个东西到底是个什么东西呢?其实千人千面就是给到不同的买家展示不一样的产品,就像我们拿出手机淘宝去跟身边的朋友对比一下,会发现搜索同样的淘宝关键词展现的宝贝跟他们的是不一样的。这其实就是所谓的千人千面的展示。