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ncbi中查找基因序列的方法和三个号码是什么
2020-04-08 14:46:46 责编:小OO

GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性.对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而 且这个编号对应的序列不可更改.这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与我们用的身份证号.因此,利用GI在NCBI中查询时

怎样在ncbi中查找基因序列的方法和三个号码?来看看吧!

材料/工具

电脑

方法

首先打来浏览器,输入“https://www.ncbi.nlm.nih.gov”。

1、打开NCBI 百度搜索键入“NCBI”,点击“搜索”,第一个就是官方主页,点击打开。 2、关键字查找 以H9亚型流感病毒HA基因下载为例,说明详细过程。 既然要下载基因序列,需要在栏目内找到“Nucleotide”(核苷酸),搜索栏内填入“Avian influenza vi

在search中选择“BioProject”,然后点击“search”。

1、直接通过浏览器搜索ncbi,选择对应网站跳转。 2、这个时候弹出新的窗口,需要根据实际情况搜索相关信息。 3、下一步如果没问题,就继续在图示位置点击进入。 4、这样一来会看到其中的结果,即可在NCBI上查找某一基因在不同种属中已公布的同源

新界面中选择:“genome” 。

先搜到目的基因,然后display里面选genbank 里面会给基因编号 完全说明的最下面还会有mRNA和蛋白编号

新窗口中选择:“Prokaryotic Genome Annotation”。

以Ache2基因作为例子。12这个是关于Ache2基因的各种完整、不完整的dna、rna、cds序列。这个是数据库里存有的三个物种的Ache2基因全序列。要下载全序列的话,点Gene。点击genebank(除了序列还有一些文字信息)或者fasta(直接下载序列)。省略后

出现“genomeproject”选项,选择下拉框内需要查找的菌的域名:例如:“Euryarchaeota(广古菌域)” 。

详细参考ncbi handbook中entriz检索系统。 支持布尔运算符。 你需要:首先了解ncbi里有哪些大的数据库,什么是布尔运算符。 基因名称,物种拉丁文,目的片段长度阈值等,根据它来检索即可。

下拉滚动条,选择要下载基因组的菌株名,例如:MethanococcusvoltaeA3 。

打开NCBI主页; 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称; 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属; 再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色

在display选项中选择:“ProtienFASTA”,如果想下载序列,选择sendto中的文件格式,保存即可。

1 打开NCBI主页 2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称 3 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。 4 再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的

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怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?

在ncbi 的search搜索框上面有下拉框选项,里面可以选基因序列(nucleotide)或者蛋白质序列(protein)

怎样用NCBI搜索基因组序列啊

wenku.baidu.com/view/ffe309d9ad51f01dc281f183.html

看看,很容易的

【求助/交流】如何从NCBI上查找已知序列号的基因全长

这是NCBI的网站,然后在serch中输入你的基因序列号,即可以得到。下载到序列(就是复制和黏贴的过程),然后可以对这断序列进行编辑了。我一般用的DNAstar,我已经抄上传了附件。你解压后安装,然后从开始菜单的程序里直接找到DNAstar,在里面点击EditSeq,然后出zhidao现的页面的左上角选择file,子文件第一个是new里面有DNA和protein2个选择,就可以进去阅读和编辑了~~~如果有需要,我可以再给你提供一个BLAST工具~~本回答被提问者采纳

已知基因序列,请问怎么在ncbi上查找该基因的保守序列,急,希望大家帮帮我

1 打开NCBI主页

2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称

3 在出来的所有条目知第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人道Felis catus是猫。选择你想要的种属。

4 再出现的页面中找到那个像数轴的图,专在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择GENEBANK。

5 最下面就是他的基因属序列 当然也可以参考页面上提供的CDS区域范围来看。

如何在NCBI上查找某一基因序列及其启动子

直接在NCBI主页输入你要找的基因的名字,比如S1PR1,然后搜索,找到下面的内容:

Genes

90Gene: collected information about gene loci

1HomoloGene: homologous gene sets for selected organisms

12UniGene: clusters of expressed transcripts

点90进去,里面是NCBI上这个基因在不同e799bee5baa6e79fa5e9819331333363383336物种中的所有序列,找到是链霉菌这个物种就ok,我如果找人的话,就应该是:

S1PR1 – sphingosine-1-phosphate receptor 1 [Homo sapiens (human)]

然后再点进去

Genomic

NG_.1 RefSeqGene

Range

5001..9772

Download

GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)

mRNA and Protein(s)

NM_.4 → NP_.2 sphingosine 1-phosphate receptor 1

See proteins identical to NP_.2

Status: REVIEWED

pfam00001

Location:68 – 311

Blast Score: 367

7tm_1; 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)

Source sequence(s)

BC, CR, DB, DB

Consensus CDS

CCDS777.1

UniProtKB/Swiss-Prot

P21453

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ENSP, OTTHUMP, ENST, OTTHUMT

Conserved Domains (1) summary

GenBank和FASTA可以查看它在基因组上的序列

NM_.4 和 NP_.2分别是其mRNA序列和蛋白质序列

祝好!本回答被提问者采纳

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